对于出口越南海防的FORM E产地证，若通过代理公司代理出具，且产地证抬头为代理公司，同时其他清关资料单据也需改为代理公司抬头，这通常会影响出口公司享受原产地优惠的资格。具体来说，FORM E产地证是越南海关用于证明货物原产地的文件，其抬头必须与出口商名称一致。若代理公司作为抬头，意味着在越南进口申报时，进口商可能无法确认货物原产自出口公司，从而可能无法享受关税减免或退税政策。因此，代理公司抬头可能导致出口公司失去原产地证明的有效性，进而影响退税。

在实际操作中，若代理公司要求将所有清关资料改为其公司抬头，出口公司应谨慎评估。建议咨询越南海关或税务机构，确认是否允许代理公司作为抬头并享受原产地优惠。通常，为了确保退税资格，出口公司需要确保产地证抬头与出口商一致，且所有相关单据（如商业发票、装箱单等）均以出口公司名义出具。如果必须通过代理公司办理，应要求代理公司提供授权证明，明确出口公司为实际出口商，并在单据上注明代理关系，以保留原产地证明的有效性。

总结来说，是否可以退税取决于越南海关对代理公司抬头的具体规定。若政策要求产地证抬头必须为出口商，则代理公司抬头可能导致无法享受原产地优惠，进而无法退税。出口公司应优先考虑通过合法途径（如自己申请或与有资质的代理公司合作，确保抬头正确）来获取有效的FORM E产地证，以保障退税权益。