是的，这种情况在很多贸易实践中是常见且被允许的，但这需要根据中澳自由贸易协定（FTA）的具体规定以及海关的审核标准来判断。关键在于理解原产地证上“出口商”与提单上“shipper”的内涵。 在国际贸易中，通常存在实际出口商和报关出口商之分。在本案例中，您公司是负责将货物最终出口给澳大利亚客户的报关出口商，而工厂是实际生产并负责将货物从工厂出口的实体。中澳FTA原产地证上的“出口商”通常指的是“实际出口商”，即负责将货物实际从中国出口的实体。因此，如果工厂是实际出口商，那么在原产地证上标注工厂的抬头是完全符合逻辑的。 提单上的“shipper”是您公司，这表示货物是以您公司的名义进行运输的。这种安排在间接出口或转口贸易中很常见。只要原产地证上的其他关键信息，如发票号、装箱单号、货物描述等与您公司的发票、提单完全一致，并且原产地证上明确标注了工厂作为实际出口商，那么通常不会被海关拒绝。海关主要审核的是原产地证的真实性和完整性，以及是否符合协定规则。 总结来说，只要工厂作为实际出口商，您公司作为报关出口商，并且原产地证上的所有信息（尤其是与您公司单据匹配的信息）准确无误，那么中澳FTA原产地证出口商与提单shipper不一致通常是可以接受的。不过，为了确保万无一失，建议您在向客户提交前，可以与澳大利亚客户或其代理进行确认，看其是否对这种安排有特殊要求。