您好，您遇到的情况很常见。印尼作为东盟重要成员，对进口商品的认证要求非常严格。客户要求提供东盟FORM E证书，这通常是进口商为了确保货物符合东盟标准并享受关税优惠而提出的。

对于香港的离岸公司，申请东盟FORM E证书需要准备一系列文件。首先，您需要提供公司注册的官方文件，包括公司注册证书（CR）和营业执照。此外，由于您是在香港注册的公司，可能需要提供香港公司商业登记证和税务登记证，以证明公司的合法性和纳税记录。如果印尼海关要求，还需要提供公司法定地址的证明文件，以确认公司实际经营地址。

申请流程通常需要与印尼海关直接沟通。您可以通过以下步骤进行：首先，确定货物出口后，向印尼出口商协会或直接向印尼海关总署提交申请。申请时，您需要填写详细的表格，并附上出口发票、装箱单、提单等单据。通常，需要支付一定的申请费用。提交后，印尼海关会对您的申请进行审核。审核通过后，会发放FORM E证书。整个流程可能需要几周时间，具体时间取决于海关的繁忙程度和审核的严格程度。

对于香港的离岸公司，一个关键点在于，由于香港和印尼的税务和公司法规不同，海关可能对公司的税务记录有额外要求。因此，确保您的公司账目清晰，并准备好所有税务相关文件，可以大大提高审核通过率。此外，建议在出口前就与印尼客户沟通，了解他们具体的申请要求和截止日期，以便提前准备。

总而言之，香港离岸公司可以按照上述流程申请东盟FORM E证书。虽然流程可能比国内公司复杂一些，但只要准备充分，并按照印尼海关的要求提交材料，通常能够成功获得。建议您在出口前，预留足够的时间来完成整个申请流程，以避免货物到港后无法通关。