原产地证和提单上的发货人名称不一致，这在国际贸易中属于比较常见但又需要谨慎处理的情况。通常，原产地证的出具方（即发货人）和提单上的发货人（即卖方）应当保持一致，以明确货物的所有权和责任主体。如果两者不一致，可能会引起海关的注意，并可能对关税计算或货物所有权产生疑问。具体到您的情况，提单上的发货人是您公司，而CO产地证上的收货人包含了代理公司，这种安排需要特别注意。

对于您出口到埃塞俄比亚的货物，这种不一致是否会影响清关，关键在于埃塞俄比亚海关的具体规定。通常，如果代理公司作为收货人，而您公司是最终买方，需要提供代理协议、销售合同等文件作为证明，以说明货物的最终所有权和清关责任。海关可能会要求您提供这些文件以解释这种安排的合法性。因此，虽然从理论上讲，发货人和收货人可以不同，但为了顺利清关，建议您准备充分的商业文件，并可能需要与代理公司确认，确保其出具的CO符合当地海关的要求。

总结来说，原产地证和提单发货人名称不一致理论上存在风险，但并非绝对不可行。只要能提供充分的商业证明，并符合进口国的海关规定，通常是可以接受的。在发货前，最好能咨询埃塞俄比亚当地海关或通过使馆渠道获取更具体的指导，以规避潜在的清关风险。