您提出的关于在越南FORM E产地证中勾选“第三方发票”的问题，是许多内地公司出口到越南时都会遇到的困惑点。首先，需要明确的是，FORM E产地证允许勾选“第三方发票”选项，但这通常意味着产地证上的发货人信息与实际发货人信息不一致。对于内地公司而言，这通常是为了满足越南海关对发票和产地证上信息一致性的要求。

当您选择勾选“第三方发票”时，代办公司（即您找的代理公司）的名称会作为产地证上的发货人。这通常是为了规避一些复杂的税务或合规要求。在这种情况下，您在提单上的发货人信息（即您自己的公司）与产地证上的信息将不同。这需要您在填写产地证时，将代办公司作为“发货人”信息进行填写，而不是您自己的公司。

关于您提到的货描部分，它通常指的是货物描述。如果产地证上勾选了“第三方发票”，并且代办公司作为发货人，那么产地证上的发货人信息将与提单上的发货人信息不同。这可能导致越南海关在查验时产生疑问，因为商业发票、提单和产地证上的发货人信息不一致。为了确保产地证的有效性，通常建议在产地证上如实填写提单的发货人信息，或者与代理公司进行更详细的沟通，以确保所有单据信息完全一致。

您担心的海关查验和客户无法使用产地证的问题，确实是存在的。如果产地证上的信息与越南海关要求的标准不符，产地证可能会被拒绝，导致您的货物在清关时被滞留，甚至可能被要求补交税款。这会给您的越南客户带来麻烦，影响交货期。因此，正确处理“第三方发票”的勾选至关重要。通常，这需要您提供完整的提单、商业发票等文件给代理，由他们根据文件内容来正确填写产地证。

为了确保万无一失，建议您与您的代理公司进行更深入的沟通。向他们提供您所有相关的单据，并明确您希望如何处理发货人信息。一个经验丰富的代理会了解最新的政策，并能够正确地处理这种情况，从而避免任何潜在的问题。在处理首次申请时，可以更谨慎一些，确保所有信息都经过仔细核对，以降低风险。