对于印尼FORM E产地证，通常情况下，出口商的注册地址应填写在文件上。如果您的香港公司在中国大陆有地址，并且提单上只显示公司名称而不显示地址，这可能会引发一些问题。海关或进口商在核对文件时，可能会因为地址信息不匹配而产生疑问。

FORM E作为原产地证明文件，其信息必须准确无误。如果文件上填写的是香港地址，而提单上显示的是另一个地址，这可能会导致文件被海关质疑，甚至拒绝通关。因此，为了确保顺利通关，建议在FORM E上填写香港公司的实际注册地址。

如果确实需要将中国大陆地址写入FORM E，这通常不被官方推荐，但理论上可能。这样做可能会增加风险，因为海关可能会要求提供更多证明文件来解释地址差异。例如，您可能需要提供香港公司的商业登记证、税务登记证以及证明中国实体与香港公司关系的文件，以佐证地址的变更或双重注册。

总结来说，最稳妥的做法是在FORM E上填写香港公司的注册地址。这既符合常规操作，也能最大程度地避免因信息不一致而导致的通关延误或问题。如果必须使用中国大陆地址，务必做好充分的准备，并准备好所有必要的证明文件以应对可能的审查。