您遇到的情况非常普遍，也是很多出口企业容易混淆的。根据中巴FTA原产地证的规定，生产商一栏通常指的是货物的实际生产或加工方。对于您作为一家贸易公司，拥有货物出口到巴基斯坦，客户要求将您的公司名称填入中巴FTA原产地证的生产商栏，并以此作为申请退税的依据，这确实存在一定的操作难点。

审核机构在审核时，会严格遵循原产地证的定义。如果您的公司是纯粹的贸易公司，没有生产设施、没有生产线，那么它不具备作为生产商的资格。原产地证的核心目的是证明货物是在特定国家/地区生产，以享受关税优惠。将贸易公司作为生产商填写，会违背原产地证的真实性和有效性，因此很可能会被审核不通过。客户要求您公司作为生产商，可能是因为他们需要向巴基斯坦的税务机构证明，货物确实是由他们指定的公司生产，从而确保退税流程的顺利进行。

那么，您现在该怎么办呢？建议您采取以下措施：首先，修改申请信息。在办理原产地证时，将生产商栏填写为货物的实际生产工厂名称，而不是您的贸易公司名称。您可以在申请时附上相关证明文件，例如，实际生产工厂的营业执照、工厂地址证明等，以证明您是作为贸易公司代表该工厂进行出口。其次，明确角色定位。在原产地证上，您的公司可以作为出口商，而实际工厂作为生产商。这是国际贸易中非常常见的做法，即出口商和生产商可以分离。您也可以向审核机构提供一份说明，解释您的贸易角色以及与实际生产商的关系。

总结来说，中巴FTA原产地证的生产商栏原则上不应由贸易公司填写。您需要将实际的生产工厂信息提供给审核机构。通过提供制造商的证明文件，并明确您作为贸易公司的代理角色，通常可以顺利解决审核不通过的问题，确保客户能够顺利获得巴基斯坦的退税优惠。建议您立即与审核机构或原产地证申请机构沟通，提供正确的信息并附上必要的证明材料，以尽快解决问题。