对于“一个订单分两次出货，我们做原产地证是要做一份还是两份呢？两次出货原产地证可以合并出吗？”这个问题，答案是：通常可以合并，但需要满足特定条件。具体来说，如果两次出货属于同一个订单，并且有相同的原产地证申请信息（例如，同一个发票号码、合同号码、出口商和进口商），那么可以合并出具一份。然而，如果两次出货属于不同的订单，或者有不同原产地证的申请信息，那么通常需要分别出具。总的来说，两次出货原产地证能否合并，主要取决于出口商的申请以及出口国海关的规定。建议您咨询专业的报关代理或查阅相关贸易协定的具体条款，以确保符合所有要求。