您遇到的这个情况确实比较普遍，也触及了FORM E证书申请流程中的一个核心问题。首先，FORM E是越南海关用于证明货物原产地并享受关税优惠的官方文件，其申请主体通常是产品的生产厂家。这是因为海关需要核实产品确实是在指定国家（或地区）生产，且未经过中间贸易环节的干扰，以确保原产地真实性。您作为贸易公司，虽然与生产厂家有合作，但海关系统通常要求生产厂家进行产品备案，并直接由他们来申请和提交FORM E产地证书。您在海关网站上的注册备案，属于贸易公司的备案，与产品本身的原产地备案是分开的。因此，您不能直接申请，需要让生产厂家协助办理。这个过程可能比您想象的要复杂一些，因为涉及到多个环节和海关的严格审核。建议您与生产厂家沟通，明确他们如何处理这个申请，通常他们会提供相应的服务，或者您需要提供一些必要的信息给他们，以便他们代表您完成申请。总结来说，FORM E证书一定要生产厂家才能申请吗？答案是，通常情况下，贸易公司无法直接申请，必须通过生产厂家来办理。