关于您提到的贸促会发票认证和原产地证是否可以在不同地方办理，通常情况下，这是不推荐的，也是不被贸促会系统所允许的。贸促会为了确保贸易数据的准确性和可追溯性，通常要求公司在其注册地或经营地的贸促会进行所有文件的处理和审核。

更关键的是，您遇到的金额问题。贸促会对于发票金额的审核非常严格。如果发票金额与报关单上的金额不一致，贸促会可能会认为存在虚假申报，从而拒绝认证，并可能对您和客户进行处罚。这属于严重的贸易欺诈行为，会严重影响公司的信誉。

建议您首先与客户进行充分沟通，争取客户同意将发票金额与报关单金额保持一致。这是最合规、最稳妥的解决方案。如果客户坚持要求做低金额，您可以考虑咨询更专业的法律或税务顾问，评估是否存在其他合法的解决方案，但这通常会增加成本和风险。对于您的情况，最理想的做法是确保所有单据的金额完全一致，然后通过公司自行或委托当地代理办理认证。如果实在找不到本地代理，可以考虑与异地代理沟通，但需要确认其能否为您在嘉兴的公司提供认证服务，这通常需要特殊授权，操作起来比较复杂。