印尼驻华大使馆确认函，即 SURAT KETERANGAN，是一种由印尼驻华大使馆签发的官方文件。它主要用于确认特定文件或信息的真实性、合法性，或对某项事务的官方确认。这种认证通常用于商业、法律或官方事务中，以增强文件的效力。

是的，印尼驻华大使馆确认函可以代办。由于印尼驻华大使馆通常不接受个人直接递交申请，因此需要通过指定的代办机构来处理。对于在中国境内的申请人，通常需要联系与印尼驻北京大使馆合作的代办机构。虽然印尼驻上海总领事馆等机构可能提供领事服务，但针对此类特定认证，通常仍需遵循驻北京大使馆的官方流程。代办机构将协助您准备所有必要的文件，并提交给相关使馆。

您提到的两种认证，即 CCPIT印尼使馆认证 和 印尼驻华大使馆确认函，通常用于不同的目的。前者是对公司文件（如公司章程、营业执照）本身的认证，证明该文件是真实有效的。后者则是对这些认证过的文件所附的特定声明或补充说明的官方确认。在很多国际商务场景中，这两者可能需要同时进行，以全面证明文件的真实性和法律效力。

总的来说，代办流程通常包括：准备原始文件、填写申请表、通过代办机构提交给驻北京的大使馆、等待处理、领取认证文件。整个过程需要一定的时间，具体时长可能因文件数量、使馆工作量等因素而异。建议您联系专业的代办服务，以确保流程的顺利进行。