您提出的关于印尼FORM E产地证改版后海关政策的问题，是当前许多出口商关注的焦点。自8月20日印尼对FORM E产地证进行改版以来，确实有部分客户反映，他们要求提供的产地证必须由生产工厂直接出具，而不再接受贸易公司或出口商出具的版本。这引发了关于印尼海关是否已完全停止认可贸易商出具的FORM E的疑问。

首先，需要明确FORM E的官方定义。FORM E是一种简化原产地证明文件，用于证明货物符合印尼的关税优惠条件。其核心目的是确保进口商能够享受正确的关税待遇。改版通常是为了使文件更清晰、更符合国际标准，并可能更严格地定义“生产者”或“制造商”的身份。

在实践中，印尼海关对于FORM E的出具主体存在一定的灵活性。通常情况下，出口商（即您所在的公司）可以自行出具FORM E，并提交给海关。然而，随着贸易政策的收紧，部分进口商或最终用户为了确保货物原产地的真实性和合规性，可能会对产地证明文件提出更严格的要求。他们可能希望看到直接由生产工厂出具的证明，以避免任何中间环节可能带来的不确定性。这并非海关的硬性规定，而更多是进口商或最终用户出于自身风险管理的考虑。

针对您的情况，建议您采取以下步骤：首先，仔细核对印尼海关或相关贸易机构（如印尼投资与出口促进局）发布的最新官方通知，确认是否有关于FORM E出具主体的明确禁令。其次，与您的客户（即最终进口商）进行直接沟通，明确告知他们您作为出口商的角色，以及工厂作为生产者的角色。解释新版的FORM E是否已符合印尼的官方要求。如果客户坚持要求工厂出具的版本，您可以考虑与工厂合作，由工厂在您提供原始数据的基础上，以工厂名义重新出具一份FORM E，并附上您与工厂之间的出口合同或授权书作为支持文件。这通常可以满足客户的特定需求。

总而言之，印尼海关目前并未发布完全禁止贸易商出具FORM E的官方通知。虽然部分客户因风险控制而提出更高要求，但出口商仍可继续办理。关键在于根据客户的具体要求，灵活调整操作流程，确保所有文件均符合印尼最新的法规要求，并最终顺利通过海关查验。