您遇到的情况很常见，即客户在货物开船后两个月才要求提供CO产地证。通常情况下，只要货物信息没有发生重大变更，开船后两个月内办理CO产地证是完全可行的，但需要根据具体情况进行处理。

首先，CO产地证，即原产地证，是一种证明货物原产地的官方文件。它对于进口国海关的关税减免、贸易统计以及某些贸易协定下的优惠待遇至关重要。根据不同的贸易目的，CO可以分为多种类型，例如普通原产地证和普惠制原产地证，它们在申请流程和所需材料上有所不同。

客户在开船后才提出此要求，可能是因为他们需要将货物运抵进口国后，用于办理进口清关手续、申请进口国关税优惠或满足进口国其他贸易法规的要求。这通常不会影响您这边补办CO的可行性，但需要确认客户的具体要求。

尽管开船后两个月办理CO产地证是可能的，但您需要注意几个关键点。首先，时间窗口。对于一些需要与货物运抵时间挂钩的CO（如普惠制原产地证），可能会有一个相对较短的截止期限。其次，信息一致性。如果开船时货物信息与实际存在出入，补办CO可能会比较复杂。最后，流程与成本。补办CO可能需要额外的时间，并且可能产生一定的费用。

面对这种情况，您可以按照以下步骤来处理：首先，与您的客户沟通，明确他们需要的是哪种类型的CO产地证，以及他们需要这份文件的具体用途。然后，检查您现有的单据，如商业发票、提单和装箱单，确保有足够的信息来申请CO。如果CO是由您合作的工厂或出口商代为办理的，您需要及时联系他们，提供开船后的最新信息，并协助他们完成补办流程。

在准备材料时，除了常规的发票和提单外，可能还需要工厂出具的证明文件，说明货物的生产地和原材料来源。如果您的货物是从两家不同工厂采购的，那么需要明确每批货物的具体来源，以便在CO上正确标注。最后，将所有材料提交给相关的认证机构或官方机构，按照规定流程完成申请。

总而言之，开船两个月后办理CO产地证是可行的，但需要您及时行动，并确保所有信息准确无误。建议您尽快与相关方联系，以避免延误，并确保顺利获得客户所需的文件。