您好，您提到的在台北中转办理的“未加工证明”通常被称为“FORM E”或“未加工证明”，这是用于证明货物在特定国家/地区（如台湾）未进行加工或制造，以享受更优惠的关税待遇。在台北中转时，这通常由当地海关或指定的报关机构负责处理。

通常，您可以在台北机场内的海关柜台或指定的服务窗口办理。办理时，您需要向航空公司或机场的客服人员说明您的需求，他们通常会为您开具申请单，并指引您到相应的海关部门。在提交材料时，通常需要提供您的FORM E申请表（可能需要正本或扫描件，具体要求请以现场指示为准）以及您的护照、机票等旅行相关文件。

关于您询问的“办理时需要FORM E正本吗？还是扫描件就可以”这个问题，在实际操作中，很多情况下，航空公司或海关会接受扫描件或电子版的FORM E申请。但为了确保万无一失，建议您在办理前先咨询一下您乘坐的航班航空公司或机场的官方客服，确认他们是否接受电子版，以及是否需要提前在线填写并打印出来。通常，提前准备一份清晰的扫描件会更有帮助，以防万一。

总而言之，在台北中转办理未加工证明是一个常规流程，但为了顺利通过，建议您提前与您的航空公司或机场客服沟通，了解具体要求和所需文件。这样能确保您的中转流程更加顺畅，并顺利获得所需的证明文件。