是的，即使货物已经从澳大利亚海关清关提走，您仍然可以补办澳大利亚原产地证，并用于抵扣关税。这主要基于中澳自由贸易协定（中澳FTA）的相关规定。该协定明确允许在货物清关后，通过补办原产地证来享受关税优惠。这意味着，即使客人在最初清关时未要求提供，您也可以在货物抵达后，根据实际需要，为货物申请并获取原产地证。

这种“清关后补办”的机制为出口商提供了极大的灵活性。它避免了因客户临时要求而导致的货物滞留或重新清关的麻烦。更重要的是，它确保了货物能够充分利用中澳FTA的关税减免政策，从而显著降低您的出口成本。原产地证作为享受优惠关税的凭证，其效力通常不受清关时间的限制，只要证明文件符合相关标准即可。

那么，在实际操作中，您需要了解哪些关键点呢？首先，补办原产地证需要您提供完整的货物信息，包括商品编码、数量、价值等，这些信息应与海关的清关记录一致。其次，补办流程可能需要一些时间，具体取决于您选择的认证机构（如中国国际贸易促进委员会，CCPIT）的效率。建议您尽早与认证机构沟通，并准备好所有必要的文件，以确保原产地证能够及时签发。最后，请注意，补办的原产地证通常会有一个“补发”或“后补”的标记，海关在审核时需要确认其真实性和有效性。

总而言之，对于您的情况，补办澳大利亚原产地证并用于抵扣关税是完全可行的。关键在于及时、准确地完成补办流程，并确保所有文件符合中澳FTA的要求。这样做不仅能满足客户的需求，更能帮助您最大化地利用贸易协定带来的经济利益。