首先，FORM RCEP原产地证书和中澳FTA原产地证在适用范围上存在显著差异。RCEP，即区域全面经济伙伴关系协定，是一个涵盖15个成员国的区域贸易协定。而中澳FTA，即中国-澳大利亚自由贸易协定，则是专门针对中国与澳大利亚两国之间的贸易关系。这意味着，如果您的产品出口到RCEP其他成员国（如东盟国家），那么RCEP原产地证书将适用。而如果仅出口到澳大利亚，则中澳FTA原产地证可能更直接。

其次，关税优惠是选择的关键。RCEP为区域内产品提供了统一的降税安排，而中澳FTA则针对两国特定产品设定了更低的关税。在实际操作中，通常会先查询两种证书对应的关税税率。如果RCEP证书能为您争取到更低的关税，那么就优先办理RCEP原产地证书。反之，如果中澳FTA的优惠更为显著，则应选择中澳FTA原产地证。有时，两种证书的优惠待遇可能完全相同，此时选择哪个则取决于出口目的地的具体要求。

总结来说，企业在出口澳大利亚时，应遵循“优惠待遇优先”的原则。具体来说，如果RCEP原产地证书能为您带来更低的关税，那么就优先办理RCEP证书。如果中澳FTA的优惠更优，则应办理中澳FTA原产地证。如果两者待遇一致，则可以选择办理其中一种。此外，还需注意，有些进口国可能对特定产品有明确的原产地要求，企业应结合具体出口商品和目标市场，综合判断选择哪种原产地证书更为有利。