是的，办理FORM E产地证通常需要与报关单（或发票）内容保持一致。这是为了确保原产地证明的准确性和有效性，避免因信息不符而导致后续的审核问题或贸易纠纷。

对于您提到的第一个问题，即HS编码不一致。FORM E上的海关编码必须与实际出口货物的编码完全匹配。如果客户要求填写一个与报关单不同的编码，这可能会导致原产地认定错误。例如，如果实际货物属于某个关税优惠类别，而FORM E上填写了另一个类别，进口国海关可能会质疑其原产地资格，从而影响关税优惠的享受。因此，在制作FORM E前，必须核实并使用正确的海关编码。

关于第二个问题，即金额不一致。FORM E上列明的金额应与实际出口的货物价值完全一致。如果客户要求填写一个低于实际金额的数值，这同样存在风险。如果该商品享受的是基于金额的关税优惠，那么较低的申报金额可能导致进口商无法获得应有的关税减免，甚至可能需要补缴差额的税款。反之，如果FORM E上的金额高于实际金额，虽然可能不会产生直接的经济损失，但这是不诚信的行为，一旦被发现，可能会对企业的信誉和未来的贸易合作造成负面影响。因此，保持金额一致是确保贸易合规的关键。

综上所述，为了确保FORM E的合法性和有效性，建议您在制作前，与客户进行充分沟通，确认所有关键信息（包括具体商品描述、HS编码、单价、数量以及最终金额）都与报关单完全一致。如果客户有特殊要求，应首先核实其合规性，必要时可以咨询相关贸易政策或海关专家，以避免潜在的风险。