关于FORM E品名显示与商业发票一致性的问题，需要从海关监管和单据匹配的角度进行深入分析。首先，商业发票和FORM E作为核心单据，其品名、数量、包装等信息的匹配度至关重要，这直接关系到货物清关的顺利与否。

通常情况下，FORM E的品名列示会遵循以下原则：如果一批货物包含多个品名但属于同一个商品编码（HS编码），那么可以合并归类；如果属于不同商品编码，则需要分别列出。您提到商业发票上有5个品名，但只有3个商品编码，这表明部分品名可能属于同一个HS编码。因此，在制作FORM E时，可以按商品编码进行归类，但必须确保所有5个品名都包含在对应的商品编码下，或者如果客户有特殊要求，也可以尝试将所有品名都列出来，但这需要符合海关的具体规定。

客户要求5个品名全部显示，以与商业发票一致，这是一个合理的客户需求。在实际操作中，您可以考虑在FORM E的品名栏位中，将所有5个品名按顺序列出，并在备注栏或通过其他方式注明其对应的商品编码。例如，可以将所有5个品名合并为一个商品编码项，或者为每个品名分配一个子项，但最终需要确保其总数量和总包装数与商业发票一致。关键在于保持单据间信息的一致性，避免因品名列示差异导致海关质疑。

对于两个不同编码的商品放在一个箱子里的情况，这属于混合包装或合并装箱。处理方式通常是在FORM E的包装数（Number of Packages）栏位中，明确填写每个商品编码对应的包装数量。例如，如果箱子内包含商品A（编码1）和B（编码2），那么您需要将这个箱子作为一个包装单位（例如1个箱），然后在数量（Quantity）栏位中分别填写A和B的数量，并在包装数栏位中填写1。或者，如果箱子被拆分成多个小包装，则需要分别填写每个小包装的数量和包装数。具体操作需要根据实际装箱情况，并确保与商业发票上的信息相匹配。例如，如果商业发票上显示为“1箱，内含商品A 100件，商品B 50件”，那么FORM E上应填写：商品A，数量100，包装数1；商品B，数量50，包装数1，总包装数为1（即整个箱子作为一个包装单位）。这样既满足了客户要求的一致性，又符合海关的申报要求。